2014年7月8日火曜日-バルデブロン研究所(VHIR)の研究者チームは、これまで完全に未知であった518の新しい微生物をヒト微生物叢(腸内細菌叢)で特定した国際調査に参加しました。
科学者がバイオインフォマティクス分析に新しいアプローチを採用したこの研究は、既知の微生物遺伝子のカタログを300万から1000万に拡大しました。
Nature Biotechnologyが日曜日に発表したこの研究の結果は、ヨーロッパのMetaHITプロジェクト(Metagenomics Human Intestinal Tract)の一部であり、人間のミクロビオームが健康と病気にどのように関係するかを調査するために1, 140万ユーロが寄付されました。 バルデブロン研究所(VHIR)は、このプロジェクトに参加している13のうちの1つであり、研究対象のすべてのサンプルがこれを持っているわけではないと説明したDr. Francisco Guarnerの指導の下、スペインで唯一のセンターです。未知の種の数。
一部の個体の腸内細菌叢のサンプルには、これらの種がほとんど含まれておらず、詳細に分析すると、クローン病患者のサンプルであることがわかりました。 「これは、これまで知られていなかったこれらの種が、健康な人の微生物叢と病気の人の微生物叢を区別する可能性があることを示唆している」とGuarnerは発表した。
研究者によると、これらのデータは栄養介入でこれらの種を回復しようとする戦略を開きます:繊維、いくつかの種またはプロバイオティクスの選択的成長を助けるプレバイオティクスの投与。
これらの未知の細菌は、おそらく「善玉菌」と呼ばれます。これは、それらが感染を引き起こす典型的なものではなく、以前に知られていないか、分離されていないためです。 ガーナーによれば、発見された細菌は「移植するために結腸の外で生き残ることはほぼ間違いない」ため、分離することはできません。
VHIR Group of Physiology and Digestive Pathophysiologyの研究と研究の責任者は、発見された新種は「栽培可能ではなく、酸素に非常に敏感です。つまり、非常に厳しい嫌気性菌であり、環境に大きく依存していることを示しています。生き残る。」 「同じ理由で、データベースにアクセスしたときに痕跡が見つからず、今までそれらについて何も知りませんでした」とGuarner氏は言いました。
これらの種の「表面化」を可能にしたバイオインフォマティクス分析への新しいアプローチのおかげで、発見が可能になりました。
「現在-Guarnerによると-シーケンスされた遺伝物質のうち95%の信頼性で知られているのは10%だけです。これにより、現在作業中の大きな灰色の領域が残ります。」
この研究では、741種類のメタゲノム種が検出され、それらに名前を割り当てることができないことから命名されました。 データベースと比較すると、研究者はこれらの種のうち115種がすでに知られているのに対し、518種は知られていないことを発見した。 残りの108個は部分的に既知です。
「これらのメタゲノム種のゲノムがどのように見えるかはわかっていますが、名前と姓はわかりません」とGuarnerは説明しました。
種は知られていない少数ですが、性別や属が記載されており、記載されている種の約200のメタゲノム種は、それらの遺伝子の80%以上が完全に未知であるため、いかなる方法でも分類できません今日
科学者によると、人間に住んでいる微生物は約1, 000億で、人間の細胞の総数の10倍です。
2010年のこの同じプロジェクトの初期結果は、3, 300, 000の異なる遺伝子を指し、20, 000の異なる機能に変換されましたが、そのうち5, 000が完全に未知でした。
各人にはこれらの微生物遺伝子が約600, 000あり、300, 000はすべての個人間で絶えず繰り返されています。 「この新しい研究では、数に3を掛けて、9, 879, 896個の異なる遺伝子に到達しました」とGuarner氏は述べています。
出典:www.DiarioSalud.net
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科学者がバイオインフォマティクス分析に新しいアプローチを採用したこの研究は、既知の微生物遺伝子のカタログを300万から1000万に拡大しました。
Nature Biotechnologyが日曜日に発表したこの研究の結果は、ヨーロッパのMetaHITプロジェクト(Metagenomics Human Intestinal Tract)の一部であり、人間のミクロビオームが健康と病気にどのように関係するかを調査するために1, 140万ユーロが寄付されました。 バルデブロン研究所(VHIR)は、このプロジェクトに参加している13のうちの1つであり、研究対象のすべてのサンプルがこれを持っているわけではないと説明したDr. Francisco Guarnerの指導の下、スペインで唯一のセンターです。未知の種の数。
一部の個体の腸内細菌叢のサンプルには、これらの種がほとんど含まれておらず、詳細に分析すると、クローン病患者のサンプルであることがわかりました。 「これは、これまで知られていなかったこれらの種が、健康な人の微生物叢と病気の人の微生物叢を区別する可能性があることを示唆している」とGuarnerは発表した。
「善玉菌」
研究者によると、これらのデータは栄養介入でこれらの種を回復しようとする戦略を開きます:繊維、いくつかの種またはプロバイオティクスの選択的成長を助けるプレバイオティクスの投与。
これらの未知の細菌は、おそらく「善玉菌」と呼ばれます。これは、それらが感染を引き起こす典型的なものではなく、以前に知られていないか、分離されていないためです。 ガーナーによれば、発見された細菌は「移植するために結腸の外で生き残ることはほぼ間違いない」ため、分離することはできません。
VHIR Group of Physiology and Digestive Pathophysiologyの研究と研究の責任者は、発見された新種は「栽培可能ではなく、酸素に非常に敏感です。つまり、非常に厳しい嫌気性菌であり、環境に大きく依存していることを示しています。生き残る。」 「同じ理由で、データベースにアクセスしたときに痕跡が見つからず、今までそれらについて何も知りませんでした」とGuarner氏は言いました。
異なるメタゲノム種
これらの種の「表面化」を可能にしたバイオインフォマティクス分析への新しいアプローチのおかげで、発見が可能になりました。
「現在-Guarnerによると-シーケンスされた遺伝物質のうち95%の信頼性で知られているのは10%だけです。これにより、現在作業中の大きな灰色の領域が残ります。」
この研究では、741種類のメタゲノム種が検出され、それらに名前を割り当てることができないことから命名されました。 データベースと比較すると、研究者はこれらの種のうち115種がすでに知られているのに対し、518種は知られていないことを発見した。 残りの108個は部分的に既知です。
「これらのメタゲノム種のゲノムがどのように見えるかはわかっていますが、名前と姓はわかりません」とGuarnerは説明しました。
種は知られていない少数ですが、性別や属が記載されており、記載されている種の約200のメタゲノム種は、それらの遺伝子の80%以上が完全に未知であるため、いかなる方法でも分類できません今日
人は600, 000個の微生物遺伝子を持っています
科学者によると、人間に住んでいる微生物は約1, 000億で、人間の細胞の総数の10倍です。
2010年のこの同じプロジェクトの初期結果は、3, 300, 000の異なる遺伝子を指し、20, 000の異なる機能に変換されましたが、そのうち5, 000が完全に未知でした。
各人にはこれらの微生物遺伝子が約600, 000あり、300, 000はすべての個人間で絶えず繰り返されています。 「この新しい研究では、数に3を掛けて、9, 879, 896個の異なる遺伝子に到達しました」とGuarner氏は述べています。
出典:www.DiarioSalud.net